בית מדרש שערים מאפשר לתלמידיו למצוא את השער שדרכו יבחרו לבוא בברית עם ה' ועם תורתו. התוכנית נועדה לאפשר 'הרכבה אישית' לכל תלמיד, של מינוני מקצועות התורה השונים, בתרכובת מותאמת אישית.
גמרא עיון – הרב מאיר ליכטנשטיין "מצות עשה על כל איש ואיש מישראל לכתוב ספר תורה לעצמו שנאמר ועתה כתבו לכם את השירה" (רמב"ם תפילין ומזוזה וספר תורה ז, א)
תכלית השער להעמיד תלמידי חכמים בחכמת האגדה: ההגות, האמונה והנפש – המבקשים דעת א-לקים ודרכי התגלותו במציאות, ועולם האגדה הוא להם בית ואהבה, והם מאירים מתורת האגדה על סביבתם.
תכלית השער להעמיד תלמידי חכמים בתנ"ך: המבקשים להתבונן בדבר ה' ביד משה וביד נביאיו, להבינו בכל כלי ההבנה המצויים ברשותנו – מסורתיים וחדשים, לרדת לעומקו, ולינוק ממנו חכמה, דעת ומוסר לימינו אנו.
ישיבת אורות שאול, מקיימת תוכנית לימודי הלכה, שמטרתה הצמחת תלמידי חכמים, בעלי כושר מנהיגות, אשר יוכלו לשמש כרבנים ומורי הוראה בקהילות ישראל, באהבת תורה ויראת שמים, ברחבות אופקים וכישורים המתאימים למנהיגות קהילתית ואישית.
בימ"ד שערים מבקש להרחיב את אופק המחשבה והנפש של תלמידיו, לפתוח את המחשבה ואת הלב, על מנת להפוך לאנשים עובדי ה' שלמים יותר, ולבעלי יכולות וכישורים להתמודד עם אתגרי הזמן והתרבות, לפעול בהם, ולהיות שותפים בהתרקמותם.